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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

感染新冠后，出现眼部不适怎么办？ 眼科专家答疑******

　　“我阳了以后右眼红3天、流泪明显增加了。”“我发烧好了以后左眼磨、怕光很明显”“我测抗原阳了2天后看东西有点模糊”……近日，感染新冠病毒后发生眼部不适的患者出现在北京老年医院眼科门诊。老年医院眼科副主任医师赵慧英提醒：感染新冠病毒后如出现眼部不适，可用冷敷方法缓解眼痛等不适，如果不适感持续存在，应及时去医院就诊。

　　赵慧英介绍，感染新冠病毒后，眼红、眼痛、视力下降等是较为常见的眼部不适。赵慧英说，结膜炎是新冠病毒感染后最常见的眼部表现。患者主要表现为眼红、异物感、流泪等不适，可以为单眼或双眼发病，可发生于新冠感染的各个阶段。“目前认为结膜炎发生可能与新冠病毒直接侵害结膜组织或者新冠病毒感染机体后免疫系统攻击结膜组织有关。手眼接触可能会增加结膜炎的发生。”

　　浅层巩膜炎也可见于新冠病毒感染患者，表现为局部眼红、眼痛、流泪等不适。赵慧英说，多数浅层巩膜炎表现出自限性，既往研究显示约1/3浅层巩膜炎患者可能与病毒感染有关。葡萄膜炎、角膜炎也可引起新冠感染者眼红。此外，由于新冠病毒激活炎症因子导致三叉神经功能障碍，阳性感染者还可能出现眼痛。

　　视网膜中央静脉阻塞是新冠病毒感染引致的众多血管疾病之一，患者可表现为视物模糊、视物变形等。视网膜中央动脉阻塞也可发生于新冠感染者。主要表现为突然发生的无痛性视力下降。此外，新冠感染者也可由于眼底毛细血管缺血引起急性黄斑神经视网膜病变，表现为单眼或双眼的无痛性视力下降或者视物遮挡。

　　“阳”后出现眼部表现应该怎么办呢？赵慧英提醒，首先应积极治疗原发病，比如高热时合并的眼痛，需要按照医嘱使用退烧药物。眼部进行冷敷可以用来缓解眼痛等不适。若出现视力下降要及时到有眼科的医疗机构就诊以免延误治疗。眼红、眼痛等不适持续存在的患者也应该到医疗机构就诊。手眼接触可能会增加结膜炎的发生，因此要尽量避免用手揉眼睛，以免发生眼部感染。(北京日报客户端记者 孙乐琪)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）